Nonostante la drastica riduzione di contributi da parte del Ministero dei Beni Culturali e il periodo di crisi che ha chiuso numerose vie di finanziamento, il CIRSES continua a svolgere ricerche negli ambiti di maggiore interesse rispetto alla propria mission e al know-how delle/dei sue/suoi socie/i e collaboratrici/ori, autofinanziando la propria attività scientifica.

Tra le attività più importanti sviluppate negli ultimi anni vi sono le due ricerche Transessualismi e transgenderismi e Valutazione delle Reti Territoriali - ISFOL.